La homofobia afecta a heterosexuales y homosexuales por igual. Sin embargo, su expresión en homosexuales podría ser distinta a su manifestación en heterosexuales (como la depresión infantil se manifiesta con síntomas distintos a la depresión en adultos). Esto por una sencilla razón: en el caso de un gay, discriminador y discriminado se encuentran en el mismo lugar. Esto significa que un homosexual aquejado de homofobia se hará a sí mismo lo que un heterosexual le haría a un homosexual.

Como una guía presentamos la siguiente tabla comparativa de los síntomas de la homofobia internalizada respecto de la homofobia general.
| HOMOFOBIA | HOMOFOBIA INTERNALIZADA | |
| Lenguaje injurioso | Insultos (“eres un enfermo”). Fantasías de superioridad (“los heterosexuales somos mejores personas”) | Pensamientos autodescalificadores (“soy un degenerado”) Fantasías de inferioridad (“si fuese heterosexual sería mejor”) |
| Exclusión | Conductas discriminadoras: poner barreras externas para impedir el acceso ciertos objetos (trabajo, salud y servicios, amistades) | Vergüenza, culpa, baja autoestima: barreras internas que impiden tomar riesgos y acceder a nuevas y mejores oportunidades. |
| Abuso | Golpes y maltrato físico | Conductas autodestructivas (abuso de alcohol y drogas, sexo desprotegido) |
| Expresión extrema de odio | Asesinato | Suicidio |